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J’ai publié une réutilisation de quatre jeux de données covid-19
mis à disposition par Santé Publique France, sur la plateforme data.gouv.fr :
Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19
Données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (production interrompue par SPF depuis le 29/05)
Données relatives aux résultats
des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP)
Les quatre jeux de données étant à la
granularité du département. Le référentiel d'enrichissement est donc identique
pour chacun d’entre eux.
Il comporte 17 colonnes qui précèdent celles des données :
Préfecture du dpt, indication de la
préfecture de région, latitude et longitude (pour carto),
superficie, décès, population INSEE, par tranches d'âge, etc..
Lien de téléchargement (formats .csv et tableur) : referentiel_enrichissement_SPF.zip
Liens
de téléchargement (.csv) des quatre source enrichies le dimanche 2 août 2020 :
Les données
sont actualisées du lundi au vendredi
par Santé Publique France pour la source 1
Source 1 : Données
hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19 (31/07)
Source 2 : Données des urgences hospitalières et de
SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19 (01/08)
Source 3 : Données relatives aux tests de
dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (29/05) non
actualisée par SPF
Source 4 :Données relatives
aux résultats des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP) (30/07)
Mon
dépôt git, public et (très) basique : https://github.com/fcafca/Enrichissement-des-donnees-COVID-19-Sante-Publique-France
Pour échanger,
c’est ici (contacter le producteur) :
https://www.data.gouv.fr/fr/reuses/croisement-des-fichiers-et-enrichissement-du-jeu-de-donnees-publie-par-sante-publique-france/
J’ai
démarré la réalisation d’une série de tableaux de bord, avec l’outil libre et
open source Apache
Superset qui représente une alternative crédible au « poids
lourd » du secteur : Tableau.
Malheureusement, pour l’instant, je ne dispose pas d’une instance dimensionnée
pour proposer un accès public à Superset.
Dans l’attente, je publie ces copies d’écran. Trois thèmes sont abordés :
Thème 1 : Evaluation du déconfinement depuis le 1er
juin (nouvelle version)
Pour résumer la situation en ce début du mois de Juillet, mis à part en Guyane
et à Mayotte, l’épidémie est annoncée comme globalement maîtrisée.
En revanche, le virus est toujours là.
La situation est mesurée par Santé Publique France au travers d’un point
hebdomadaire publié en fin de semaine.
Le point central d’attention tourne autour des fameux « clusters »,
et notre capacité à les traiter au fur et à mesure de leurs apparitions.
Le PDF de l’analyse nationale est pour le moins consistant. 31 pages de
graphiques accompagnés de commentaires, pour certains assez « obscurs ».
Certaines données
ne sont pas publiques, notamment celles qui concernent le détail et la
localisation des clusters.
Pour celles qui sont accessibles et issues des trois sources disponibles citées
en début de page, j’ai pour objectif de reprendre certains de leurs graphiques,
en plus « détaillé ».
Le dashboard
réalisé est un premier jet, une sorte de brouillon que je compte bien améliorer
dans les jours à venir.
02/08 : Résumé du Point
épidémiologique hebdomadaire du 30 juillet 2020
Île-de-France :
« En Ile-de-France, 34 clusters sont toujours actifs. Si la moitié d’entre
eux sont maîtrisés, les autorités intensifient les campagnes de dépistages à la
recherche de foyers
passés sous les radars »
Pays de la Loire : « Les
autorités sanitaires ont identifié quinze nouveaux clusters de coronavirus en Mayenne, a-t-on appris mardi
soir auprès de la préfecture. Dans ce département où la reprise de l’épidémie
se fait sentir depuis plus de quinze jours, le taux de positivité est légèrement
descendu. Mais la propagation se poursuit et le préfet a pris
de nouvelles mesures de restriction. »
(France Info 17/07/2020)
Grand Est : «»
(France Info 17/07/2020)
Thème 2 : Chiffres clés
Thème 3 : Retour aux urgences des patients « non
covid » (AVC, infarctus…)
Focus sur les moins de 15
ans :
Focus
sur les 75 ans et plus :
Région
Île-de-France : La situation tend à revenir à la normale, mais pas
complètement
Région Île-de-France :
Focus sur les moins de 15 ans : Le différentiel avant/après confinement reste important
Région Île-de-France :
Focus sur les 75 ans et plus
