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J’ai publié une réutilisation  de quatre jeux de données covid-19 mis à disposition par Santé Publique France, sur la plateforme data.gouv.fr :

Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19

Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19

Données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (production interrompue par SPF depuis le 29/05)

Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP)

 

Les quatre jeux de données étant à la granularité du département. Le référentiel d'enrichissement est donc identique pour chacun d’entre eux.
Il comporte 17 colonnes qui précèdent celles des données :

Préfecture du dpt, indication de la préfecture de région, latitude et longitude (pour carto), superficie, décès, population INSEE, par tranches d'âge, etc..
Lien de téléchargement (formats .csv et tableur) : referentiel_enrichissement_SPF.zip

Liens de téléchargement (.csv) des quatre source enrichies le dimanche 2 août 2020 :
Les données sont actualisées du lundi au vendredi par Santé Publique France pour la source 1

Source 1 : Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19 (31/07)

Source 2 : Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19 (01/08)

Source 3 : Données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (29/05) non actualisée par SPF

Source 4 :Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP) (30/07)


Mon dépôt git, public et (très) basique : https://github.com/fcafca/Enrichissement-des-donnees-COVID-19-Sante-Publique-France

 

Pour échanger, c’est ici (contacter le producteur) : https://www.data.gouv.fr/fr/reuses/croisement-des-fichiers-et-enrichissement-du-jeu-de-donnees-publie-par-sante-publique-france/


J’ai démarré la réalisation d’une série de tableaux de bord, avec l’outil libre et open source Apache Superset qui représente une alternative crédible au « poids lourd » du secteur : Tableau.
Malheureusement, pour l’instant, je ne dispose pas d’une instance dimensionnée pour proposer un accès public à Superset.
Dans l’attente, je publie ces copies d’écran. Trois thèmes sont abordés :

 

Thème 1 : Evaluation du déconfinement depuis le 1er juin (nouvelle version) 


Pour résumer la situation en ce début du mois de Juillet, mis à part en Guyane et à Mayotte, l’épidémie est annoncée comme globalement maîtrisée.
En revanche, le virus est toujours là. La situation est mesurée par Santé Publique France au travers d’un point hebdomadaire publié en fin de semaine.
Le point central d’attention tourne autour des fameux « clusters », et notre capacité à les traiter au fur et à mesure de leurs apparitions.
Le PDF de l’analyse nationale est pour le moins consistant. 31 pages de graphiques accompagnés de commentaires, pour certains assez « obscurs ».

https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-national/covid-19-point-epidemiologique-du-17-juillet-2020

Certaines données ne sont pas publiques, notamment celles qui concernent le détail et la localisation des clusters.
Pour celles qui sont accessibles et issues des trois sources disponibles citées en début de page, j’ai pour objectif de reprendre certains de leurs graphiques, en plus « détaillé ».

Le dashboard réalisé est un premier jet, une sorte de brouillon que je compte bien améliorer dans les jours à venir.



02/08 : Résumé du Point épidémiologique hebdomadaire du 30 juillet 2020

 


Île-de-France : « En Ile-de-France, 34 clusters sont toujours actifs. Si la moitié d’entre eux sont maîtrisés, les autorités intensifient les campagnes de dépistages à la recherche de foyers passés sous les radars »




Pays de la Loire : « Les autorités sanitaires ont identifié quinze nouveaux clusters de coronavirus en Mayenne, a-t-on appris mardi soir auprès de la préfecture. Dans ce département où la reprise de l’épidémie se fait sentir depuis plus de quinze jours, le taux de positivité est légèrement descendu. Mais la propagation se poursuit et le préfet a pris de nouvelles mesures de restriction. »
(France Info 17/07/2020)




Grand Est : «»
(France Info 17/07/2020)

Une image contenant texte, carte

Description générée automatiquement


Thème 2 : Chiffres clés

 

 

 

 

 

 

 

 

Thème 3 : Retour aux urgences des patients « non covid » (AVC, infarctus…)

 

 



Focus sur les moins de 15 ans :


 

Focus sur les 75 ans et plus :

 


 
Région Île-de-France : La situation tend à revenir à la normale, mais pas complètement



Région Île-de-France : Focus sur les moins de 15 ans : Le différentiel avant/après confinement reste important


Région Île-de-France : Focus sur les 75 ans et plus